超初心者向け!! RNA-seq解析シリーズの記事になります。 今回は、解析に使うデータを公共データベースからダウンロードしていきたいと思います。 これまでの記事はこちら↓ ● 超初心者向け！！誰でもできる！！RNA-seqのデータを自分で解析しよう - LifeScien…

この記事は、誰でもできる！！初心者向けRNA-seq解析シリーズの３つ目の記事になります。 これまでの記事はこちら ● 超初心者向け！！誰でもできる！！RNA-seqのデータを自分で解析しよう - LifeScience Hack ● 超初心者向け！！RNA-seq解析シリーズ① ターミ…

自分でRNA-seqの解析をする方法をゼロから書いていきたいと思います。 ●「RNA-seq解析は、専門知識がないとできない」 ●「RNA-seqの解析は数万/sampleの外注で行う」 と考えている方は結構多いのかと思います。 企業などで研究費が一杯あればそれでいいのか…

Wetしかしたことない、コマンドラインなにそれ？な人でも、 RNA-seqくらい自分で解析できるようになりたい！！ という人のために、 同じような状況だった僕が、 今回からはPythonメインではないのですが、 RNA-seqデータの解析を自前でできるようにしたいと…

お久しぶりになりました。 相変わらず、ちょこまかといろいろやっております。 最近、UniProtからデータを引っこ抜くことが多いのですが、 UniProtからxmlでデータを取得した後、pythonのlxmlで目的の項目を抜き出す際に ちょっとしたトラップがありました。…