PythonでPubmedから論文情報を取得するシリーズの続きです。 今回はESummaryを使って論文のタイトル等の情報をゲットしていきます。 前回までに検索で該当する論文のPMIDを取得できました。 これまでの記事はこちら ● Pythonで論文情報をまとめてゲットする①…

前回までにPythonを使った論文情報取得のための準備が完了しました。 今回は実際にPythonを使って論文検索し、HitするPMIDを取得したいと思います。 ESearchについて Queryの作成 Requestsによる検索結果の取得 検索結果をresponseとして受け取る responseの…

今回はPythonでPubmed APIを使うための準備編です。 概要 パッケージのインストール パッケージのインポート

ブログのタイトルがLifeScience Hack with AIですが、 AIのことを書く前に、Pythonで研究生活を効率化する方法を書いていきたいと思います。研究生活の効率化の一つとして、論文調査がありますよね。 それをボタン一つでまとめる方法を細かく連載していきた…

もうずいぶん昔から、構造解析などの分野ではプログラムが必須なのは当たり前ですが、ここで言及したいのは、特定の分野ではなく、全生物学研究者にプログラミングの知識および扱えることが必要かとういうことです。要は、現在誰もがPCR実験をできるレベルで…

はじめまして、tottohamです。 ブログを作成するにあたり、自己紹介したいと思います。 ライフサイエンス系の研究に従事して早10年以上となりました。 現在は某製薬企業で研究職をしており、完全ウェットの人間です。