かなり間隔があいてしまいましたが、 論文情報をまとめて取るシリーズの最新版です。 今回はEFetchを用いて、アブストラクトを取ってこようと思います。 これまでの記事の内容が理解できていることを前提としたいと思います。 これまでの記事はこちら ● Pyth…

今回はこれまでにゲットした情報をExcelに保存したいと思います。 これまでの記事はこちら ● Pythonで論文情報をまとめてゲットする①~ PubMed APIについて~ ● Pythonで論文情報をまとめてゲットする②~ 下準備 ~ ● Pythonで論文情報をまとめてゲットする③~ ES…

PythonでPubmedから論文情報を取得するシリーズの続きです。 今回はESummaryを使って論文のタイトル等の情報をゲットしていきます。 前回までに検索で該当する論文のPMIDを取得できました。 これまでの記事はこちら ● Pythonで論文情報をまとめてゲットする①…

前回までにPythonを使った論文情報取得のための準備が完了しました。 今回は実際にPythonを使って論文検索し、HitするPMIDを取得したいと思います。 ESearchについて Queryの作成 Requestsによる検索結果の取得 検索結果をresponseとして受け取る responseの…

今回はPythonでPubmed APIを使うための準備編です。 概要 パッケージのインストール パッケージのインポート

ブログのタイトルがLifeScience Hack with AIですが、 AIのことを書く前に、Pythonで研究生活を効率化する方法を書いていきたいと思います。研究生活の効率化の一つとして、論文調査がありますよね。 それをボタン一つでまとめる方法を細かく連載していきた…