PCRプライマーのTm値の計算機を作ってみよう -0-

lifesciencehack-ai.hatenablog.com

何かを作りながらPythonの基礎を学ぼうかと思います。
仕事で使えそうなもののほうがモチベーションが上がるので、
今回はPCRで使うプライマーのTm値計算機を作ってみます。
また、細かく書いていきたいのでシリーズになります。

構想

プライマーのTm値の計算法を理解する

1. Wallace法
2. 最近接塩基対法 lifesciencehack-ai.hatenablog.com

Pythonを使って次のようなことができるようにする

1. プライマーの配列を入れるとTm値を返す
2. 相補鎖配列を返す
3. GC%を返す
4. エクセルに配列を入れるとバッチ処理してくれる

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学ぶこと

Tm値計算機作成にあたってpythonの以下のような方法を使います。

• Pythonでの文字列の取扱い
• Pythonでの計算
• 関数の作成
• Pandas による表計算・DataTableの取扱い
• openpyxlによるExcelの読み書き

では、次回から作っていきましょう！！

PCRプライマーのTm値の計算機を作ってみよう①~相補鎖配列とGC含量の計算~ - LifeScience Hack

ちなみに、PythonではないですがJavascriptでTm値の計算機を作りました。
こちらもご利用ください。

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