LifeScience Hack

生物系創薬研究者がAI(誇大表示)を手に入れるまでの過程(Python、Deep Learning、ライフサイエンス)

プライマーのTm値計算機

PCRを実施する際のアニーリング温度の参考に、
プライマーのTm値の計算機を作りました。
鋭意改良していきますので、こうしてほしいとかがあればコメントください。

プライマーTm値計算機

Sequence 5'- -3'
Complement 5'- -3'
Length base GC% %
Wallace法 最近接塩基対法
Tm (℃)

Wallace法の計算式

Tm = 2 x (AとTの数の総和) + 4 x (GとCの数の総和)

最近接塩基対法の計算式

Tm = (1000 x ΔH) /( -10.8 + ΔS + 1.987 x ln(Conc/4)) - 273.15 + 16.6log[Na+]

参考過去記事

具体的な計算方法は過去記事にしておりますので、ご参考にどうぞ

PythonGC%や相補鎖配列を取得する方法はこちら↓ lifesciencehack-ai.hatenablog.com

↓Wallace法や最近接塩基対法の詳しい計算方法はこちら↓ lifesciencehack-ai.hatenablog.com

Pythonで自分でTm値計算を実装したいひとはこちら↓ lifesciencehack-ai.hatenablog.com